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我國科學(xué)家實現(xiàn)對斑馬魚全腦十萬級神經(jīng)元實時監(jiān)控

2024/3/25 7:48:20 來源:IT之家 作者:汪淼 責(zé)編:汪淼

IT之家 3 月 25 日消息,據(jù)中國科學(xué)院自動化研究所消息,該所蒿杰研究組與中國科學(xué)院腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心杜久林研究組、穆宇研究組合作研究開發(fā)了一套實感智能計算-控制平臺,可快速提取和分析斑馬魚全腦神經(jīng)元活動,實現(xiàn)神經(jīng)元集群活動的閉環(huán)調(diào)控。

相關(guān)研究論文以 Real-time analysis of large-scale neuronal imaging enables closed-loop investigation of neural dynamics 為題,在線發(fā)表于《自然?神經(jīng)科學(xué)》(Nature Neuroscience)。

據(jù)介紹,該研究借助天文學(xué)領(lǐng)域的數(shù)據(jù)處理技術(shù),采用 FPGA-GPU 混合架構(gòu),成功對高達 500MB/s的大數(shù)據(jù)流神經(jīng)功能數(shù)據(jù)進行實時配準(zhǔn)、信號提取和分析。通過這一技術(shù)突破,研究團隊首次實現(xiàn)了對斑馬魚全腦十萬級神經(jīng)元的實時監(jiān)控,進而對任意選擇的神經(jīng)元集群活動進行解碼,以控制外部設(shè)備。

這一成果標(biāo)志著基于全腦單細胞光學(xué)成像的虛擬現(xiàn)實、光遺傳調(diào)控等技術(shù)在腦科學(xué)閉環(huán)研究領(lǐng)域的應(yīng)用邁出了關(guān)鍵一步。

全腦范圍單神經(jīng)元活動成像是解析大腦并行分布式計算原理的有力工具,但其巨大的數(shù)據(jù)實時處理需求成為了技術(shù)發(fā)展的瓶頸,導(dǎo)致難以實時分析以及在大尺度上閉環(huán)調(diào)控和研究腦功能。

啟發(fā)于天文學(xué)領(lǐng)域中快速射電暴檢測技術(shù),研究人員借鑒其系統(tǒng)設(shè)計策略,利用 FPGA 編程的靈活性建立光學(xué)神經(jīng)信號預(yù)處理系統(tǒng),對來自光學(xué)傳感器的信號規(guī)整化,并將其發(fā)送給基于 GPU 的實時處理系統(tǒng),進行高速非線性配準(zhǔn),提取各信道的神經(jīng)信號,依據(jù)編碼規(guī)則進行解碼,以獲得用于控制外部器件的反饋信號。該系統(tǒng)通過實時監(jiān)測斑馬魚全腦神經(jīng)元的活動,生成反饋信號,反饋間隔小于 70.5 毫秒。

實感智能計算-控制平臺架構(gòu)及利用該系統(tǒng)實施的光學(xué)腦機接口技術(shù),通過大腦內(nèi)部神經(jīng)元集群的活動實現(xiàn)虛擬現(xiàn)實控制

▲ 實感智能計算-控制平臺架構(gòu)及利用該系統(tǒng)實施的光學(xué)腦機接口技術(shù),通過大腦內(nèi)部神經(jīng)元集群的活動實現(xiàn)虛擬現(xiàn)實控制

系統(tǒng)性能在三個腦科學(xué)閉環(huán)研究場景下得到展示:與任意特定神經(jīng)元集群活動鎖相的實時光遺傳學(xué)刺激,與特定大腦功能狀態(tài)鎖相的實時視覺刺激,以及基于神經(jīng)元集群活動的虛擬現(xiàn)實控制。

  • 閉環(huán)實時光遺傳學(xué)神經(jīng)調(diào)控:通過功能聚類識別全腦神經(jīng)元集群,將選定集群的自發(fā)活動作為觸發(fā)信號,實施實時光遺傳學(xué)刺激于目標(biāo)神經(jīng)元集群。相對于開環(huán),閉環(huán)刺激有效激活了下游腦區(qū)。

  • 鎖相的實時視覺刺激實驗:通過對藍斑去甲腎上腺素能系統(tǒng)活動的實時監(jiān)測,在表征動物清醒狀態(tài)的藍斑興奮時相上施加視覺刺激,觀察到大腦中其他神經(jīng)元的反應(yīng)更為強烈。這表明,大腦狀態(tài)可調(diào)節(jié)對視覺信息的處理,同時指出閉環(huán)感覺刺激有助于精確研究大腦內(nèi)部狀態(tài)與外界環(huán)境的相互作用。

  • 全腦光學(xué)腦機接口實現(xiàn)的虛擬現(xiàn)實:實時將高維的全腦所有神經(jīng)元活動降維到多個神經(jīng)元集群的活動,并將任一集群的活動與視覺環(huán)境閉環(huán)聯(lián)接,建立了基于光學(xué)成像、直接從腦神經(jīng)活動到視覺環(huán)境的虛擬現(xiàn)實系統(tǒng)。在該虛擬現(xiàn)實中,可以隨意調(diào)整神經(jīng)活動與環(huán)境耦合的增益,使控制環(huán)境的神經(jīng)元集群根據(jù)增益變化適應(yīng)性地調(diào)整其輸出。依托大數(shù)據(jù)流的實時分析和高通量全腦成像技術(shù),未來研究將篩選適合光學(xué)腦機接口的神經(jīng)群體活動特征,揭示其機制,并開發(fā)出更高效的光學(xué)腦機接口技術(shù)。

中國科學(xué)院腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心杜久林研究員、中國科學(xué)院自動化研究所蒿杰研究員、中國科學(xué)院腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心穆宇研究員為共同通訊作者;暨南大學(xué) / 深圳市神經(jīng)科學(xué)研究院尚春峰研究員(原中國科學(xué)院腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心副研究員)、中國科學(xué)院腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心汪玙璠博士、中國科學(xué)院自動化研究所趙美婷助理研究員為共同第一作者;中國科學(xué)院自動化研究所范秋香助理研究員,中國科學(xué)院腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心趙姍博士生、錢禹工程師和徐圣進研究員做出了重要貢獻。

該工作得到科技部、基金委、中國科學(xué)院、上海市和深圳市的資助。研究成果已授權(quán)發(fā)明專利“光學(xué)腦機接口系統(tǒng)和方法”(專利號:ZL20231 0131178.9)。

IT之家附論文鏈接:

https://www.nature.com/articles/s41593-024-01595-6

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關(guān)鍵詞:斑馬魚神經(jīng)元,腦機接口

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